Na ty hlášky o chybějících písmenech bych vám poradila
\usepackage[T1]{fontenc},
ale \clqq je zřejmě nějaká specialita toho českého balíčku.
--
Hana Skoumalova Institute of Theoretical & Computational Linguistics
Charles University
tel: +420 2 24491858 Celetna 13, 110 00 Praha 1
http://utkl.ff.cuni.cz/~skoumal Czech Republic